巴氏染色液細胞核著色過淺，鹽酸分化時間過長或蘇木素染液時間過長。需要縮短分化時間或延長堿化時間；每日加入少量新鮮蘇木素染液或重新配制蘇木素液。在固定之前制片干燥。所以對巴氏染色的制片需要嚴格遵守濕固定的原則。自來水的PH值偏酸性。使用堿性溶液。細胞核著色過深。鹽酸溶液濃度不夠。適當加入幾滴鹽酸以增加濃度。制片用高于95%以上濃度的酒精固定后可以出現染色過深。應用95%酒精固定。

透明過程:

  巴氏染色液染色的zui后一步是透明，使細胞的色度與細胞的重疊不致影響鏡下檢查。這是在脫水與制片封固之間的一項重要步驟。zui常用的透明溶劑使二甲苯，二甲苯的折射率在1.494，載玻片的折射率在1.515，兩者較為匹配。如果二甲苯溶液出現顏色或變得渾濁，一定要更換新液。 　巴氏染色操作流程 95%乙醇固定（15min）→清水沖洗多次→蘇木素染液（3-5min）→清水沖洗三次→藍化→95%乙醇漂洗→橙黃染液（1-10s）→95%乙醇漂洗→95%乙醇漂洗→100%乙醇漂洗→EA50（3-5m）→95%乙醇漂洗→95%乙醇漂洗→無水乙醇漂洗→無水乙醇（2min）→二甲苯（2min）→中性樹膠封片。

胞漿染色:

  巴氏染色液胞漿染色在巴氏方法中亦稱為OG—EA染色，它包括橘黃G（OG）和EA兩部分染色。由于橘黃G是一種小分子染料，能夠很快地作用于胞漿，一般染色時間不宜過長，通常1-2min。對于宮頸、陰道上皮中非正常角化細胞和角化型鱗癌細胞的胞漿中都可以出現鮮艷的橘黃色.封固制片,封固制片對于避免空氣干燥的影響，制片經長期存放不褪色是非常重要的.一般使用24mm×50mm或24mm×60mm的蓋玻片，用二甲苯調配的中性樹膠進行封固.